忍者の末裔である伊賀崎天晴（いがさき　たかはる）は、4年ぶりに実家の忍術道場に帰ってきた。そこで出会う、足軽に似た奇妙な化物たち。
天晴はアカニンジャーへと変化（へんげ）する！
そこへ現れる妹、風花（ふうか）と、父の旋風（つむじ）。
天晴のいとこ達も呼び寄せているという。一堂に会するいとこ達。イギリス帰りの八雲（やくも）、最年少の凪（なぎ）、大学生の霞（かすみ）。
旋風は語る。444年前に倒した戦国最恐最悪の武将、牙鬼幻月（きばおにげんげつ）が、妖怪となって復活するという予言があるというのだが……。
いよいよここに手裏剣戦隊誕生、………か？